Căn cứ theo quyết định số 5512/QĐ-BYT ngày 25/12/2015 của Bộ trưởng Bộ Y tế , Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới trung ương được định hướng trở thành cơ sở khám chữa bệnh Đa khoa với mũi nhọn chuyên sâu về các bệnh Truyền nhiễm và Nhiệt đới, trong đó có các bệnh lý gan mật. Nhằm đáp ứng nhiệm vụ được giao về phát triển đa khoa khu vực cũng như đẩy mạnh chuyên sâu trong điều trị bệnh lý gan mật, Bệnh viện đã quyết định thành lập khoa Ngoại Gan mật – Tiêu hóa và Ung bướu (Quyết định số 1914/QĐ-NĐTW ngày 01/12/2022)

Chức năng nhiệm vụ của khoa gồm khám, điều trị các bệnh lý gan mật tụy, ống tiêu hóa và ung bướu.
Khoa được xây dựng trên bộ khung của Đơn vị Ngoại Gan mật, gồm các bác sỹ đã được đào tạo chuyên sâu về các chuyên ngành phẫu thuật gan mật, tiêu hóa và ung bướu, đã có nhiều năm hoạt động chuyên môn cũng như công tác quản lý tại bệnh viện Hữu nghị Việt Đức, Bệnh viện K.

Những kỹ thuật đã và đang thực hiện của khoa Ngoại Gan mật – Tiêu hóa và Ung bướu:
    Bệnh lý gan mật tụy:
•    Ung thư gan: phẫu thuật cắt gan, đốt u gan bằng sóng cao tần, sinh thiết u gan.
•    Apxe gan: chọc hút, dẫn lưu.
•    Xơ gan: Cắt lách trong xơ gan cường lách giảm tiểu cầu, phẫu thuật làm shunt giảm áp lực tĩnh mạch cửa.
•    Bệnh lý đường mật: ung thư đường mật, sỏi mật, sỏi túi mật, nang đường mật.
•    Tụy: cắt khối tá tụy, lách thân đuôi tụy do ung thư, điều trị viêm tụy cấp, mạn tính.
    Bệnh lý tiêu hóa:
•    Các bệnh lý ung thư ống tiêu hóa (thực quản, dạ dày, đại trực tràng…)
•    Các bệnh lý lành tính: co thắt tâm vị, túi thừa, thoát vị.
•    Các bệnh lý tầng sinh môn: trĩ, rò, apxe tầng sinh môn, sa trực tràng.
    Bệnh lý ung bướu khác:
•    Phẫu thuật u sau phúc mạc.
•    Sinh thiết hạch, u.
•    Lấy nhân u vú.  
Những kỹ thuật khoa hiện đang hợp tác phối hợp thực hiện cùng các Bệnh viện khác (Bệnh viện Hữu nghị Việt Đức, Bệnh viện E):
-    Nút mạch (TACE) u gan.
-    Dẫn lưu đường mật.
-    Điều trị hóa chất.
Địa chỉ hiện tại: Tầng 2 khoa Ngoại, phòng 277
Phòng khám Gan mật – Tiêu hóa, số 213