Cần chẩn đoán phân biệt với một số bệnh có phát ban dạng sởi:

• Rubella: Phát ban không có trình tự, ít khi có viêm long.
• Nhiễm enterovirus: Phát ban không có trình tự, hay kèm rối loạn tiêu hoá.
• Bệnh do Mycoplasma pneumoniae: Sốt nhẹ, đau đầu và viêm phổi không điển hình.
• Sốt mò: Có vết loét hoại tử do côn trùng đốt.
• Phát ban mùa xuân trẻ em: Trẻ 6 tháng đến 2 tuổi, khởi đầu là tình trạng nhiễm khuẩn rồi có biểu hiện thần kinh, sau khi hết sốt thì ban mới mọc.
• Ban dị ứng: Kèm theo ngứa, tăng bạch cầu ái toan.
• Nhiễm vi rút Epstein-Barr: Hay kèm theo tăng bạch cầu đơn nhân.

Biến chứng
a) Biến chứng thần kinh

• Viêm não màng não cấp tính: Thường xuất hiện khi bệnh vào giai đoạn hồi phục. Biểu hiện lâm sàng có thể sốt lại, đau đầu, cứng gáy, co giật và thay đổi ý thức từ lú lẫn, ngủ gà tới hôn mê. Ngoài ra có thể có thất điều, rung giật cơ, múa giật-mùa vờn và các dấu hiệu viêm tuỷ như liệt hai chi dưới, liệt tứ chi, mất cảm giác, rối loạn cơ tròn, ... . Dịch não tuỷ có tăng tế bào, chủ yếu tế bào lympho và có tăng protein.
• Bên cạnh viêm não màng não cấp tính còn có thể viêm não sau khi mắc sởi nhiều năm.

b) Biến chứng bội nhiễm hay gặp ở trẻ em
- Sau khi ban bay bệnh nhân sốt lại, có tình trạng nhiễm trùng, bạch cầu máu ngoại vi tăng.
- Có thể gặp bội nhiễm ở các bộ phận sau:

• Viêm tai giữa.
• Viêm thanh quản.
• Viêm phế quản phổi.
• Viêm phổi.
• Lao tiến triển.
• Viêm loét hoại tử miệng (cam tẩu mã).
• Tiêu chảy.
• Viêm kết-giác mạc.
• Viêm cơ tim.

c) Phụ nữ mang thai bị sởi có thể bị sảy thai, thai chết lưu, đẻ non hoặc thai nhiễm sởi tiên phát.

...Chi tiết xem ở đây