Trong suốt quá trình phát triển, Bệnh viện Bệnh Nhiệt đới trung ương đã lớn mạnh cả về lượng và chất. Từ 1 một cơ sở ban đầu tại 78 Giải Phóng với 1 tòa nhà 6 tầng với diện tích 6000m2. Năm 2016, Bệnh viện đã đưa vào hoạt động cơ sở mới với diện tích 12 hecta tại Thôn Bầu xã Kim Chung, huyện Đông Anh, Hà Nội. Bệnh viện Bệnh nhiệt đới trung ương đã trở thành cơ sở khám chữa bệnh đa khoa với mũi nhọn chuyên sâu về các bệnh Truyền nhiễm và Nhiệt đới. Với 1000 giường điều trị nội trú, Bệnh viện đã đáp ứng được nhu cầu khám chữa bệnh cho người dân khu vực Hà nội, các tỉnh phía Bắc và một số tỉnh miền Trung.
Bệnh viện gồm 17 khoa lâm sàng và cận lâm sàng, 5 trung tâm, 1 viện đào tạo và 8 phòng chức năng. Nguồn nhân lực BV gồm các giáo sư, phó giáo sư, Tiến sỹ, Bác sỹ CKI, CKII với đầy đủ các chuyên ngành được đào tạo từ các trường đại học hàng đầu trong nước và quốc tế.
Hệ thống Labo xét nghiệm của Bệnh viện dưới sự tài trợ của Đại học Oxford, Vương quốc Anh được trang bị toàn bộ các hệ thống xét nghiệm hiện đại ngang tầm các nước tiên tiến trong khu vực và trên thế giới.
Bệnh viện liên tục mở rộng và đẩy mạnh phát triển các chuyên ngành Nội, Ngoại, Sản, Nhi, Tai Mũi Họng, Răng Hàm Mặt, Mắt, Y học cổ truyền và phục hồi chức năng bổ sung hỗ trợ cho chuyên ngành truyền nhiễm.
Với chức năng là tuyến cao nhất khám chữa bệnh, phục hồi chức năng về các bệnh truyền nhiễm và nhiệt đới, cùng với công tác phòng chống dịch bệnh, bệnh viện đã đối phó thành công với nhiều loại dịch bệnh mới nổi và tái nổi có diễn biến phức tạp nguy hiểm như dịch tiêu chảy cấp, bại liệt, SARS ,cúm A H1N1 cúm gia cầm H5N1, sốt xuất huyết, Rubella,…và đặc biệt là đại dịch covid 19.
Ngoài việc tổ chức, chỉ đạo chống dịch Bệnh viện tham gia cùng Bộ Y tế xây dựng các phác đồ chẩn đoán, điều trị các bệnh Truyền nhiễm và Nhiệt đới. Bệnh viện được Bộ Y tế phân công chỉ đạo tuyến cho toàn bộ hệ thống truyền nhiễm miền Bắc, miền Trung – Tây Nguyên.
Bệnh viện cũng là cơ sở thực hành về chuyên khoa các bệnh truyền nhiễm và nhiệt đới của Trường Đại học Y Hà Nội và một số trường Đại học, Cao đẳng, Trung học Y, Dược khác. Hàng năm Bệnh viện tổ chức nhiều lớp đào tạo như: Đào tạo nâng cao chuyên môn nghiệp vụ cho các bệnh viện các tuyến; Đào tạo chăm sóc điều trị HIV/AIDS cho các tỉnh trong cả nước thuộc chương trình mục tiêu Quốc gia; Đào tạo sinh viên đa khoa năm thứ 5, các lớp đào tạo cao học, nội trú, chuyên khoa 1, của ĐH Y HN và một số cơ sở đào tạo Y dược khác.
Trong lĩnh vực hợp tác quốc tế, Bệnh viện hợp tác nhiều nước trên thế giới như Anh, Hoa Kỳ, Nhật Bản, Úc,… Bệnh viện thực hiện nhiều các những nghiên cứu khoa học và hợp tác nghiên cứu về dịch tễ học lâm sàng, các yếu tố liên quan đến lây truyền bệnh nhằm xây dựng các biện pháp phòng, chống các bệnh truyền nhiễm và nhiệt đới, các dịch bệnh nguy hiểm, tối nguy hiểm, các bệnh dịch mới phát sinh: gồm đề tài cấp cơ sở, đề tài cấp bộ, cấp nhà nước và hợp tác quốc tế với thế mạnh là các nghiên cứu thử nghiệm lâm sàng về thuốc, sinh phẩm, vaccin…
